俑頭丟失案
1987年，價值40萬的俑頭在秦俑館被盜，一號坑第二次發(fā)掘被停，省考古所失去秦俑“挖掘權(quán)”
王學(xué)理，陜西省考古院研究員，參與一號坑第一次發(fā)掘。發(fā)掘被叫停后，他繼續(xù)留在坑內(nèi)從事5個探方的發(fā)掘清理工作。
他回憶說，在那時，秦俑考古隊(duì)與秦俑館在工作流程上已有摩擦。
當(dāng)時考古隊(duì)的一名成員說，白天展覽期間秦俑館不讓運(yùn)土，外賓入坑參觀前，館里讓他們快點(diǎn)打掃衛(wèi)生，并停工放假。
1979年秦俑一號坑停止發(fā)掘以來，陜西省多次要求恢復(fù)發(fā)掘，但國家文物局一直未批。
1984年，陜西文博考古體制進(jìn)行調(diào)整。
陜西省考古所并入省文物局管理，不再隸屬于省社科院。1985年，又撤銷了原先的“秦俑考古隊(duì)”，由陜西省考古所重新組建“秦陵考古隊(duì)”。隊(duì)長由所長石興邦兼任，王學(xué)理任常務(wù)副隊(duì)長。
當(dāng)時，主管文物管理的副省長孫達(dá)人要求，文物發(fā)掘歸陜西省考古研究所、文物展覽陳列歸秦俑館。
此后秦俑一號坑于1986年獲得國家文物局批準(zhǔn)，開始第二次發(fā)掘。
就在挖掘進(jìn)行地如火如荼時，1987年2月17日晚，當(dāng)?shù)?個村民翻窗進(jìn)入秦俑館，撬開考古隊(duì)的雜品庫，在堆滿考古工具的庫房里，偷走一個將軍俑頭。
這個價值約40萬的俑人頭，在半年后被追回。首犯被處以死刑。
而考古隊(duì)的發(fā)掘工作又被叫停，省文物局責(zé)成隊(duì)長石興邦作深刻檢查；撤銷王學(xué)理一切職務(wù)、取消個人發(fā)掘領(lǐng)隊(duì)資格兩年。
6月16日，現(xiàn)年75歲的王學(xué)理接受采訪時說，當(dāng)時被盜的將軍俑頭應(yīng)是先前“秦俑考古隊(duì)”與秦俑館交接時的物品，責(zé)任不該單獨(dú)由他們考古隊(duì)承擔(dān)。
陜西文博考古“改制”
秦俑館獲準(zhǔn)成立秦俑考古分隊(duì)，獲權(quán)挖掘兵馬俑坑，編寫的兵馬俑發(fā)掘報(bào)告引起世界轟動
由于“將軍俑頭”案的發(fā)生，考古所永久失去了挖掘秦俑的機(jī)會。
1988年6月23日，陜西省文物局再次對文博考古制度進(jìn)行調(diào)整。
省文物局下發(fā)通知指出，原先的體制不順，工作脫節(jié)，也不利于各項(xiàng)工作的管理和開展。并且發(fā)生文物丟失，造成嚴(yán)重?fù)p失。
為了扭轉(zhuǎn)這一局面，陜西省文物局決定，在秦陵考古隊(duì)下成立秦俑分隊(duì)，全面負(fù)責(zé)承擔(dān)秦俑館內(nèi)一、二、三號坑的考古發(fā)掘工作。
但這支“秦俑分隊(duì)”其實(shí)并不再屬于考古所。
省文物局的通知表示，秦俑分隊(duì)，行政上受秦俑館領(lǐng)導(dǎo)，業(yè)務(wù)上仍受省考古所指導(dǎo)。秦俑分隊(duì)所需考古業(yè)務(wù)人員原則上由秦俑館自己設(shè)法解決。
于是，發(fā)掘秦俑的權(quán)利從省考古所被劃到了秦俑館。
1988年，陜西省考古研究所副所長袁仲一調(diào)任秦俑館館長，同時兼任考古所副所長。
在袁仲一的主持下，秦俑館先申請發(fā)掘的是兵馬俑三號坑，1989年9月27發(fā)掘結(jié)束，并對外開放。這個坑很小，僅有62件武士俑，且是兩面相對，夾道式排列。專家們認(rèn)為，這是中國出土最早的軍隊(duì)指揮部。
隨后，秦俑館編寫了《兵馬俑一號坑考古發(fā)掘報(bào)告》和《銅車馬考古發(fā)掘報(bào)告》，在考古界引起轟動。
后來袁仲一也被外界稱為“兵馬俑之父”。
攜手探秦陵后積怨
省考古所缺經(jīng)費(fèi)與秦俑館合作勘探，秦俑館借銅鼎展覽，考古所索要未果，兩家成隙
在1988年省文物局對省考古所的工作調(diào)整之后，失去秦俑“發(fā)掘權(quán)”的“秦陵考古隊(duì)”，將勘探范圍集中在秦陵主陵部分。
但是從1988年到1994年，秦陵考古隊(duì)的勘探發(fā)掘進(jìn)展并不順利。
省考古所內(nèi)部人士說，這跟當(dāng)時所領(lǐng)導(dǎo)不重視有關(guān)。領(lǐng)導(dǎo)的興趣不在秦陵，工作不會向這邊傾斜。考古隊(duì)有錢了就干點(diǎn)，沒錢就停。
1998年出現(xiàn)轉(zhuǎn)機(jī)。國家興起西部大開發(fā)計(jì)劃，陜西省提出打造周秦漢唐文化基地的概念。
“在此機(jī)遇下，陜西省考古所開始大規(guī)�？碧角亓辍！倍吻宀ㄕf。
那年，段清波擔(dān)任秦陵考古隊(duì)隊(duì)長。
由于缺少經(jīng)費(fèi)，他去找秦俑館合作，提出由秦俑館承擔(dān)發(fā)掘的全部費(fèi)用，雙方共同組建考古隊(duì)，發(fā)掘秦陵陪葬坑。
秦俑館內(nèi)部人士說，1998年以后，秦俑館二號坑全面發(fā)掘停止，他們正好將興趣轉(zhuǎn)移到秦陵這邊。
秦俑館于1994年對二號坑進(jìn)行發(fā)掘，但發(fā)掘出的彩俑遇到空氣后，彩繪開始翹邊剝落。當(dāng)時負(fù)責(zé)發(fā)掘的秦俑館前副館長張仲立說，“主要是考慮彩繪保護(hù)問題，他們把發(fā)掘停下了。”
在秦俑館與秦陵考古隊(duì)合作的幾年內(nèi)，他們勘探發(fā)掘了秦陵的“石鎧甲坑”、“百戲俑坑”、“水禽坑”等20多座陪葬坑。
在百戲俑坑的試掘過程中發(fā)現(xiàn)舉世矚目的秦陵大銅鼎，結(jié)束了秦代沒有銅鼎出土的歷史。
但是重要文物出土后，兩家合作單位開始為文物歸屬權(quán)和考古發(fā)表權(quán)發(fā)生爭執(zhí)。
1999年，秦俑館將秦大銅鼎借走展覽，一直沒有歸還。
為此，考古所提出要求，銅鼎放在博物館展出，博物館應(yīng)將門票收入分給考古所做提成。秦俑館沒有答應(yīng)。
雙方由此出現(xiàn)裂痕，合作不再順暢。
